La RTM exploite les réseaux de transports urbains ainsi que des services complémentaires de mobilité qui lui sont confiés contractuellement par la Métropole Aix-Marseille-Provence (AMP).
- Le réseau historique marseillais (bus, métro, tramway) comprenant les communes d’Allauch, Plan-de-Cuques et Septèmes-les-Vallons.
- Les filiales :
- RTM Ouest Métropole (Réseau Ulysse) desservant Martigues, Port de Bouc, Saint-Mitre-les-Remparts
- RTM EST Métropole, (Ciotabus, le Réseau des Cigales, Les Bus des Collines) desservent La Ciotat, Ceyreste, Gémenos, Allauch, Ensuès-la-Redonne et le Rove.
- TPE Transports du Pays de l’Etoile qui exploite le réseau des Lignes de l'Agglo sur le territoire d'Aubagne et du Pays de l'Etoile
- Le Pôle Maritime :
- LaNavette : 3 lignes reliant la Pointe Rouge et l’Estaque au Vieux-Port ainsi que la Pointe Rouge aux Goudes.
- Le FerryBoat : transport maritime d’une rive à l’autre du Vieux-Port
- Le Bateau : desserte maritime de l’archipel du Frioul
- Le Transport de personnes à mobilité réduite :
- Mobimétropole
- Le Bus+ à la demande
- Transport des élèves en situation de handicap sur le territoire métropolitain
- La Gare Routière Saint-Charles : principal pôle d’échange multi-modal (lignes urbaines, interurbaines, nationales et internationales).
- Les Parkings Relais : 16 parkings relais à Marseille, situés à proximité des stations de métro offrent 4 811 places de stationnement aux abonnés RTM.